迄今未明，一般认为遗传因素和环境因素相互作用所致。大部分病例与 HLA-B27 相关。 HLA-B27 基因属 MHC I 类，根据 DNA 分型法，迄今已发现 15 种亚型。流行病学资料表明，强直性脊柱炎与 B2704 、 B2705 和 B2702 正相关，而与 B2709 和 B2706 负相关，其原因可能是由于 B27 分子某些部位氨基酸序列的差异。环境因素一般认为和感染有关，且以某些肠道阴性杆菌可能性大。
发病机制未明，可能与 HLA-B27 分子有关序列和细菌通过某种机制出现相互作用有关。分子模拟学说认为，本病由于病原体如某些肠道革兰阴性菌和 B27 分子存在共同的抗原决定簇，免疫系统在抗击外来抗原时不能识别自我而导致自身免疫病。受体学说认为 B27 分子有结合外源性多肽的作用，从而增加机体患病的易感性而致病。
1 、诱因
风寒潮湿是强直性脊柱炎的致病诱因：本病因一段时间划分为风湿类疾病的范畴，所以使人很容易想到此病和风寒潮湿润的关系，本病也确实在高寒和潮湿地区发病率较高，从事捕捞为主的鱼民比农民的发病率为高的事实。据王兆铭教授调查，本病约占半数有在风寒潮湿环境中的生活史。但在寒冷潮湿环境中长期工作的人未必都患此病，而且生活在温热带，无潮湿环境生活史的人也照样患此病，因此，风寒潮湿可能与过劳和外伤一样，是本病的一种诱发因素。
2 、病因
目前确有很多学者将强直性脊柱炎划归自身免疫性疾病。什么叫做自身免疫性疾病？原来在正常人体内，免疫活性细胞可以识别自身的细胞和外来物质，并且对外来物质进行排斥反应，但当免疫活性细胞发生突变后，即丧失了识别自身细胞和外来物质的能力，并把自身细胞误认为外来物质加以排斥，使人体的正常组织被自身的免疫细胞所破坏，由于抗原并非外来物质，而是存在于自己的身体内部，所以称之为自身免疫性疾病，在强直性脊炎病人中，人淋巴细胞组织相容抗原（ HLA-B27 ）阳性率高达 90% ，部分强直性脊柱炎病人的免疫球蛋白升高，本病用免疫抑制剂治疗有效，以上事实均支持本病是一种自身免疫性疾病。
很多病人和家属都十分关心强直性脊柱炎是如何发生及发展的，如何才能预防它的发生。国外很多专家、学者正在研究本病的病因，因为只有知道了发病的病因，才能控制疾病。但到目前为止尚没有一个很明确的答案，不过通过大量的研究观察发现发病主要同以下因素有关：
首先是在一个家族中常有 2 个以上的成员发生强直性脊柱炎。家系调查发现在强直性脊柱炎患者的第 — 代亲属中，发生强直性脊柱炎的危险性比一般人群高出 20 ～ 40 倍。孪生子女的调查中发现：单卵孪生中，另 — 个患病的可能性超过 50 ％。其次，近来的研究认为该病的发生可能与感染有天；强直性脊柱炎病人大便培养肺炎克雷白杆菌阳性率达 79 ％，而在正常人群中为 30 ％，说明患者肺炎克雷白杆菌感染的频率明显高于正常人。另外还发现强直性脊柱炎患者血清抗肺炎克雷白杆菌抗体水平明显升高，阳性率为 43.3 ％，而正常人阳性率仅 4.4 ％。柳氮磺胺吡啶治疗强直性脊柱炎收到较好的疗效，也进一步支持肠道感染与强直性脊柱炎有一定关系。
此外，还发现免疫、环境等因素也可导致发病。因此有强直性脊柱炎家族史的人应在日常生活中多加注意，如避免肠道、泌尿系感染，一旦出现此类情况要及时治疗。
强直性脊柱炎的病因尚未完全明确，目前认为与下列因素有一定关系：
(1) 基因因素：本病发病与遗传因素有密切关系，强直性脊柱炎的 HLAB27 阳性率高达 90% ～ 96% ，家族遗传阳性率达 23.7% 。类风湿者其家族的发病率为正常人的 2 ～ 1 0 倍，而强直性脊柱炎家族的发病率为正常人的 30 倍。
(2) 感染因素：泌尿生殖系感染是引起本病的重要因素之一，盆腔感染经淋巴途径播散到骶髂关节再到脊柱，还可扩散到大循环而产生全身症状及周围关节、肌腱和眼色素膜的病变。
(3) 内分泌失调或代谢障碍：由于类风湿多见于女性，而强直性脊柱炎多见于男性，故被认为内分泌失调与本病有关。但利用激素治疗类风湿并未取得明显效果，激素失调与本症的关系也没有肯定。肾上腺皮质机能亢进的病人患类风湿或强直性脊柱炎的比率无明显增加或减少。
(4) 其他因素：年龄、体质、营养不良、气候、水土、潮湿和寒冷。其它包括外伤、甲状旁腺疾病、上呼吸道感染、局部化脓感染等，可能与本病有一定关系，但证据不足 |
